rows { options { physical_type: PHYSICAL_STREAM_TYPE_QUADS max_name_table_size: 128 max_prefix_table_size: 16 max_datatype_table_size: 16 logical_type: LOGICAL_STREAM_TYPE_DATASETS version: 2 } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "RA3IE6uuFTiYbYhxK17DMEk7LCytpMhXDvFxsfH0D2YNY" } } rows { namespace { name: "this" value { prefix_id: 1 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/RA3IE6uuFTiYbYhxK17DMEk7LCytpMhXDvFxsfH0D2YNY/" } } rows { name { } } rows { namespace { name: "sub" value { prefix_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.nanopub.org/nschema#" } } rows { namespace { name: "np" value { prefix_id: 3 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/terms/" } } rows { namespace { name: "dct" value { prefix_id: 4 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/pav/" } } rows { namespace { name: "pav" value { prefix_id: 5 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" } } rows { namespace { name: "rdf" value { prefix_id: 6 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2002/07/owl#" } } rows { namespace { name: "owl" value { prefix_id: 7 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2004/03/trix/rdfg-1/" } } rows { namespace { name: "rdfg" value { prefix_id: 8 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/elements/1.1/" } } rows { namespace { name: "dce" value { prefix_id: 9 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" } } rows { namespace { name: "xsd" value { prefix_id: 10 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" } } rows { namespace { name: "rdfs" value { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/ns/prov#" } } rows { namespace { name: "prov" value { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { namespace { name: "npx" value { prefix_id: 13 name_id: 2 } } } rows { name { value: "hasAssertion" } } rows { name { value: "assertion" } } rows { name { value: "Head" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 3 name_id: 3 } o_iri { prefix_id: 2 } g_iri { } } } rows { name { value: "hasProvenance" } } rows { name { value: "provenance" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 3 } o_iri { prefix_id: 2 } } } rows { name { value: "hasPublicationInfo" } } rows { name { value: "pubinfo" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 3 } o_iri { prefix_id: 2 } } } rows { name { value: "type" } } rows { name { value: "Nanopublication" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 } o_iri { prefix_id: 3 } } } rows { prefix { value: "http://eurovoc.europa.eu/" } } rows { name { value: "2919" } } rows { prefix { value: "http://schema.org/" } } rows { name { value: "description" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 14 } p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { } g_iri { prefix_id: 2 name_id: 4 } } } rows { name { value: "name" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Environmental research" } } } rows { name { value: "DefinedTerm" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 15 } } } rows { name { value: "3941" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 14 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 13 } o_literal { } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Life sciences" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 15 } } } rows { name { value: "3946" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 14 name_id: 17 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 13 } o_literal { } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Physical sciences" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 15 } } } rows { name { value: "4921" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 14 name_id: 18 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 13 } o_literal { } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Biology" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 15 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/ro-id/" } } rows { name { value: "011545de-72ea-4477-b87e-e4a0e9c8df4b" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 19 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "in silico antibody-antigen binding database." } } } rows { prefix { id: 4 value: "https://w3id.org/ro/terms/earth-science#" } } rows { name { value: "Sentence" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 20 } } } rows { name { value: "normScore" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "25.165562913907287" } } } rows { name { value: "score" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "22.8" } } } rows { name { value: "092bc252-092d-439d-8551-fada7f4d509e" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "The reference publication is available on biorxiv, ID BIORXIV/2021/451258: Robert et al., A billion synthetic 3D-antibody-antigen complexes enable unconstrained machine-learning formalized investigation of antibody specificity prediction" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 20 } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "41.16997792494481" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "37.3" } } } rows { name { value: "0ce573ff-277b-4be8-9a5b-6a9c675e96f5" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 24 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "publication" } } } rows { name { value: "Lemma" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "7.323943661971831" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.2" } } } rows { name { value: "0f6898fa-86e3-42c4-8cff-48968d07dbdf" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 26 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antigen" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "27.605633802816904" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "19.6" } } } rows { name { value: "14804972-fa34-4e28-b8d1-7c1a8c800f2e" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 27 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "life sciences" } } } rows { name { value: "NASA" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 28 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "100.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "0.6574541926383972" } } } rows { name { value: "15a39d24-4daa-417e-99ed-4b635b56cae9" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 29 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antibody" } } } rows { name { value: "Concept" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "23.253012048192772" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "19.3" } } } rows { name { value: "286e5fd8-7d69-4aaf-854e-a0921db660a8" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 31 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "geochemistry" } } } rows { name { value: "FieldOfResearch" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 32 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "100.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "0.840290367603302" } } } rows { name { value: "45689fb7-0f9f-4c04-b03e-13e29ca1b3b7" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 33 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "software" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "9.014084507042254" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "6.4" } } } rows { name { value: "49e70145-19cf-4ac3-9da9-fb2b49f5471c" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 34 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "51258:" } } } rows { name { value: "DataCube" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 35 } } } rows { name { value: "4ad66687-f699-45ff-a561-8aea7c629d2a" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antigen" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "24.698795180722893" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "20.5" } } } rows { name { value: "5195bb19-e10e-4d1d-90e7-b7a591e2af67" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 37 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "forecast" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "4.457831325301205" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "3.7" } } } rows { name { value: "5782c378-2b05-41eb-b48b-de733932007a" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 38 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "IT-computer sciences" } } } rows { name { value: "IPTC" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 39 } } } rows { name { value: "path" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Science and technology/Technology and engineering/IT-computer sciences" } } } rows { name { value: "6aa13e0d-8332-4955-9f68-5e08e7b97b22" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "publication" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "6.506024096385542" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.4" } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/#" } } rows { name { value: "enrichment_service-account-enrichment" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 42 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "service-account-enrichment" } } } rows { prefix { id: 7 value: "http://xmlns.com/foaf/0.1/" } } rows { name { value: "Agent" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 43 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/" } } rows { name { value: "about" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 8 name_id: 2 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 44 } o_iri { prefix_id: 14 name_id: 12 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 16 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "author" } } rows { prefix { } } rows { name { value: "mailto:philippe.robert@rohub.com" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 45 } o_iri { prefix_id: 9 } } } rows { name { value: "mailto:rahmad.akbar@rohub.com" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "mailto:victor.greiff@rohub.com" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "contentSize" } } rows { datatype { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#integer" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { lex: "8927" datatype: 1 } } } rows { name { value: "contentUrl" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "https://api.rohub.org/api/ros/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/crate/download/" } } } rows { name { value: "creator" } } rows { name { value: "mailto:georgehadib@gmail.com" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 9 } } } rows { name { value: "dateCreated" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:21.217126+00:00" } } } rows { name { value: "dateModified" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "2025-03-05 00:45:34.790548+00:00" } } } rows { name { value: "datePublished" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:21.217126+00:00" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 13 } o_literal { lex: "This is a database of in silico generated antibody-antigen bindings (159 antigens times 6.9 million CDRH3 murine sequences), as resource for benchmarking machine learning methods.\n\nThe content of the files is explained in Readme.pdf\n\nThe reference publication is available on biorxiv, ID BIORXIV/2021/451258: Robert et al., A billion synthetic 3D-antibody-antigen complexes enable unconstrained machine-learning formalized investigation of antibody specificity prediction\n\nThe software used to generate the database is available at LINK: http://github.com/csi-greifflab/Absolut for all explanations." } } } rows { name { value: "encodingFormat" } } rows { quad { p_iri { name_id: 56 } o_literal { lex: "application/ld+json" } } } rows { name { value: "hasPart" } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/folders/" } } rows { name { value: "11bf7048-67f8-4f0a-a4bb-20301d65315c" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 10 } } } rows { name { value: "3d178589-9de0-4014-96e1-6267404d9e09" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "44920a68-1a59-4ca2-9b45-ed7ab6122deb" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "8d674ce9-7f97-443b-9e00-ee25f3f2d9b4" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "identifier" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b" } } } rows { name { value: "license" } } rows { prefix { value: "https://choosealicense.com/no-permission/" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Absolut! in silico antibody-antigen binding database" } } } rows { prefix { value: "http://w3id.org/ro-id/rohub/model#" } } rows { name { value: "creation_mode" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 12 name_id: 64 } o_literal { lex: "MANUAL" } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/wf4ever/ro#" } } rows { name { value: "ResearchObject" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 13 name_id: 65 } } } rows { prefix { id: 1 value: "http://purl.org/wf4ever/roevo#" } } rows { name { value: "LiveRO" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 1 } } } rows { name { value: "Dataset" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 } } } rows { prefix { id: 3 value: "http://w3id.org/ro/earth-science#" } } rows { name { value: "DataResearchObject" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 3 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 4 name_id: 68 } } } rows { prefix { id: 2 value: "https://w3id.org/contentdesc#" } } rows { name { value: "Domain" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 2 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/b3fb3d46-5fd8-41e7-a090-58181fbb01f1" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/e0ff8858-262a-485b-a8dd-728c838e8a36" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/15a39d24-4daa-417e-99ed-4b635b56cae9" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/4ad66687-f699-45ff-a561-8aea7c629d2a" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/5195bb19-e10e-4d1d-90e7-b7a591e2af67" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/6aa13e0d-8332-4955-9f68-5e08e7b97b22" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/7b70fcab-fd6b-461b-a79b-43cb859348f1" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/85946983-f823-4c28-88ad-638fd7745f37" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/89a060f4-22d1-43df-8cca-c29ee9213d21" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/9d840ee9-e861-4815-ad57-62fc3d3d062b" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/c1a70a12-6e53-4c98-9b4d-481c69d5a481" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/c4ebfa3e-5087-4695-abbd-28cb65a0d1e6" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 35 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/49e70145-19cf-4ac3-9da9-fb2b49f5471c" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 32 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/286e5fd8-7d69-4aaf-854e-a0921db660a8" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/8063038f-6dbd-4148-85a2-afb472b141cd" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 39 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/5782c378-2b05-41eb-b48b-de733932007a" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/c008e2b7-f43b-4e10-ae2b-e9b7c99d2c24" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 25 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/0ce573ff-277b-4be8-9a5b-6a9c675e96f5" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/0f6898fa-86e3-42c4-8cff-48968d07dbdf" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/45689fb7-0f9f-4c04-b03e-13e29ca1b3b7" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/9021ea62-7039-4cc7-b810-4c89cf540ee5" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/a164d3a9-ac2e-4c63-b573-2cc2e497ee5e" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/c6ab0333-3816-48d6-a0c5-f430a5569eff" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/e912021a-590a-404b-a2e0-3f2335f06f0a" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 28 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/14804972-fa34-4e28-b8d1-7c1a8c800f2e" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/fec8824a-34e3-4f6c-be08-b0863b0c242a" } } } rows { name { value: "Phrase" } } rows { quad { p_iri { name_id: 70 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/7247b893-bbcd-47aa-86dd-b27e9f592c25" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/a1c41d03-c971-45df-bfc6-b023608097a5" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/c2b8dfdb-c1fc-42e1-841c-7b0e25ca1af3" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/d1dc98f7-1b59-477f-b20e-5ce10570a46b" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/fff4fa92-d823-45bd-8cbb-df9573cbb862" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 20 } o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/011545de-72ea-4477-b87e-e4a0e9c8df4b" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/092bc252-092d-439d-8551-fada7f4d509e" } } } rows { quad { o_literal { lex: "https://w3id.org/ro-id/89a51f68-a057-4f1a-9f39-051fe69eefb6" } } } rows { prefix { id: 16 value: "https://www.w3.org/ns/iana/link-relations/relation#" } } rows { name { value: "cite-as" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 16 name_id: 71 } o_literal { lex: "Philippe ROBERT, Victor Greiff, and Rahmad Akbar. \"Absolut! in silico antibody-antigen binding database.\" ROHub. Mar 22 ,2022. https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b." } } } rows { prefix { id: 5 value: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/resources/" } } rows { name { value: "f1c05bbd-e176-46ec-b93f-7089f0df7b0f" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 58 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 57 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 72 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "data" } } } rows { prefix { id: 7 value: "http://purl.org/wf4ever/wf4ever#" } } rows { name { value: "Folder" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 73 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 name_id: 67 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 59 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "raw data" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 73 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 name_id: 67 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 60 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "metadata" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 73 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 name_id: 67 } } } rows { name { value: "77c90ab9-6433-4bd0-b613-d692bec0bcd4" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 61 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 57 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 74 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "biblio" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 73 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 name_id: 67 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 74 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 45 } o_iri { prefix_id: 9 name_id: 52 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 50 } o_literal { lex: "https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.06.451258v2" } } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 9 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:46.046298+00:00" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:46.241115+00:00" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 63 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.07.06.451258v2" } } } rows { name { value: "sdDatePublished" } } rows { quad { p_iri { name_id: 75 } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:46.046298+00:00" } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/terms/" } } rows { name { value: "BibliographicResource" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 8 name_id: 76 } } } rows { name { value: "Resource" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 7 } } } rows { name { value: "MediaObject" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 } } } rows { name { value: "bibliographicCitation" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 72 } p_iri { prefix_id: 8 name_id: 79 } o_literal { lex: "ROBERT, P., Greiff, V., Akbar, R. (2021).Absolut! in silico antibody-antigen binding database [Data set]. Norstore. https://doi.org/10.11582/2021.00063" } } } rows { name { value: "rightsHolder" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "University of Oslo (UiO)" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 10 } o_literal { lex: "Simulation" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 45 } o_iri { prefix_id: 9 name_id: 52 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 50 } o_literal { lex: "https://archive.sigma2.no/pages/public/datasetDetail.jsf?id=10.11582/2021.00063" } } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 9 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 } o_literal { lex: "2021-07-12 00:00:00" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "2022-03-22 02:24:50.074536+00:00" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 13 } o_literal { lex: "This is a database of in silico generated antibody-antigen bindings (159 antigens times 6.9 million CDRH3 murine sequences), as resource for benchmarking machine learning methods.\n\nThe content of the files is explained in Readme.pdf\n\nThe reference publication is available on biorxiv, ID BIORXIV/2021/451258: Robert et al., A billion synthetic 3D-antibody-antigen complexes enable unconstrained machine-learning formalized investigation of antibody specificity prediction\n\nThe software used to generate the database is available at LINK for all explanations." } } } rows { quad { p_iri { name_id: 63 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Absolut! in silico antibody-antigen binding database" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 75 } o_literal { lex: "2021-07-12 00:00:00" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 67 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 77 } } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 15 } } } rows { prefix { id: 14 value: "https://schema.org/" } } rows { name { value: "maintainer" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 81 } o_literal { lex: "Philippe Paul Auguste Robert" } } } rows { prefix { id: 12 value: "https://w3id.org/ro-id/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/" } } rows { name { value: "ro-crate-metadata.json" } } rows { name { value: "conformsTo" } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/ro/crate/" } } rows { name { value: "1.1" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 12 } p_iri { prefix_id: 8 } o_iri { prefix_id: 13 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 15 name_id: 44 } o_iri { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { name { value: "CreativeWork" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 85 } } } rows { prefix { id: 1 value: "https://w3id.org/ro-id/" } } rows { name { value: "7247b893-bbcd-47aa-86dd-b27e9f592c25" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "unconstrained machine-learning" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 70 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "7.515923566878981" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.9" } } } rows { name { value: "7b70fcab-fd6b-461b-a79b-43cb859348f1" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 87 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "database" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "6.144578313253011" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.1" } } } rows { name { value: "8063038f-6dbd-4148-85a2-afb472b141cd" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 88 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "earth sciences" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 32 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "100.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "0.840290367603302" } } } rows { name { value: "85946983-f823-4c28-88ad-638fd7745f37" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 89 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "binding" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "7.590361445783133" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "6.3" } } } rows { name { value: "89a060f4-22d1-43df-8cca-c29ee9213d21" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 90 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "machine learning" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "12.891566265060241" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "10.7" } } } rows { name { value: "89a51f68-a057-4f1a-9f39-051fe69eefb6" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 91 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "This is a database of in silico generated antibody-antigen bindings (159 antigens times 6.9 million CDRH3 murine sequences), as resource for benchmarking machine learning methods." } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 20 } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "33.6644591611479" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "30.5" } } } rows { name { value: "9021ea62-7039-4cc7-b810-4c89cf540ee5" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 92 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antibody" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "25.774647887323944" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "18.3" } } } rows { name { value: "9d840ee9-e861-4815-ad57-62fc3d3d062b" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 93 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "complex" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "5.783132530120482" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "4.8" } } } rows { name { value: "a164d3a9-ac2e-4c63-b573-2cc2e497ee5e" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 94 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "machine learning" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "14.647887323943662" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "10.4" } } } rows { name { value: "a1c41d03-c971-45df-bfc6-b023608097a5" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 95 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "silico antibody-antigen" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 70 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "24.331210191082807" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "19.1" } } } rows { name { value: "b3fb3d46-5fd8-41e7-a090-58181fbb01f1" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 96 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "biochemistry" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 2 name_id: 69 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 name_id: 21 } o_literal { lex: "50.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "12.7" } } } rows { name { value: "c008e2b7-f43b-4e10-ae2b-e9b7c99d2c24" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 97 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Software" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 39 } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "Economy, business and finance/Economic sector/Computing and information technology/Software" } } } rows { name { value: "c1a70a12-6e53-4c98-9b4d-481c69d5a481" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 98 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "specificity" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "3.6144578313253013" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "3.0" } } } rows { name { value: "c2b8dfdb-c1fc-42e1-841c-7b0e25ca1af3" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 99 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "specificity prediction" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 70 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "22.802547770700635" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "17.9" } } } rows { name { value: "c4ebfa3e-5087-4695-abbd-28cb65a0d1e6" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 100 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "investigation" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "5.0602409638554215" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "4.2" } } } rows { name { value: "c6ab0333-3816-48d6-a0c5-f430a5569eff" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 101 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "binding" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "8.591549295774648" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "6.1" } } } rows { name { value: "d1dc98f7-1b59-477f-b20e-5ce10570a46b" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 102 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antigens times" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 70 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "7.388535031847134" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.8" } } } rows { name { value: "e0ff8858-262a-485b-a8dd-728c838e8a36" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 103 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "immunology" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 2 name_id: 69 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 name_id: 21 } o_literal { lex: "50.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "12.7" } } } rows { name { value: "e912021a-590a-404b-a2e0-3f2335f06f0a" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 104 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Robert" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "7.042253521126761" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "5.0" } } } rows { name { value: "fec8824a-34e3-4f6c-be08-b0863b0c242a" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 105 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "life sciences (general)" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 28 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "100.0" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "0.6574541926383972" } } } rows { name { value: "fff4fa92-d823-45bd-8cbb-df9573cbb862" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 1 name_id: 106 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "antibody-antigen binding" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 4 name_id: 70 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 21 } o_literal { lex: "37.961783439490446" } } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "29.8" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 9 name_id: 52 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 14 } o_literal { lex: "Geo H." } } } rows { prefix { id: 3 value: "http://xmlns.com/foaf/0.1/" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 3 name_id: 43 } } } rows { name { value: "email" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 9 name_id: 46 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 107 } o_literal { lex: "philippe.robert@rohub.com" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 14 } o_literal { lex: "Philippe ROBERT" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 3 name_id: 43 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 9 name_id: 47 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 107 } o_literal { lex: "rahmad.akbar@rohub.com" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 14 } o_literal { lex: "Rahmad Akbar" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 3 name_id: 43 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 9 name_id: 48 } p_iri { prefix_id: 15 name_id: 107 } o_literal { lex: "victor.greiff@rohub.com" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 14 } o_literal { lex: "Victor Greiff" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 3 name_id: 43 } } } rows { prefix { id: 16 value: "https://w3id.org/np/RA3IE6uuFTiYbYhxK17DMEk7LCytpMhXDvFxsfH0D2YNY/" } } rows { prefix { id: 10 value: "http://www.w3.org/ns/prov#" } } rows { name { value: "wasDerivedFrom" } } rows { prefix { id: 5 value: "https://api.rohub.org/api/ros/71c90c65-34e6-441e-bb44-d1b31dd1007b/crate/download/" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 name_id: 4 } p_iri { prefix_id: 10 name_id: 108 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 82 } g_iri { prefix_id: 16 name_id: 7 } } } rows { prefix { id: 11 value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "created" } } rows { datatype { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 11 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 8 name_id: 109 } o_literal { lex: "2026-05-19T13:47:41.739+02:00" datatype: 2 } g_iri { prefix_id: 16 name_id: 9 } } } rows { prefix { id: 7 value: "https://w3id.org/kpxl/gen/terms/" } } rows { name { value: "RoCrateBot" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 51 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 110 } } } rows { prefix { id: 14 value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { name { value: "introduces" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 } o_iri { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { prefix { id: 13 value: "https://w3id.org/fdof/ontology#" } } rows { name { value: "FAIRDigitalObject" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 13 name_id: 112 } } } rows { name { value: "RoCrateNanopub" } } rows { quad { o_iri { prefix_id: 7 } } } rows { prefix { id: 2 value: "http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" } } rows { name { value: "label" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 2 } o_literal { lex: "Absolut! in silico antibody-antigen binding database" } } } rows { name { value: "sig" } } rows { name { value: "hasAlgorithm" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 } p_iri { prefix_id: 14 } o_literal { lex: "RSA" } } } rows { name { value: "hasPublicKey" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "MIIBIjANBgkqhkiG9w0BAQEFAAOCAQ8AMIIBCgKCAQEAxszSDYX5tuCSkP7UiCtftYPFNQVTjgNu0I5fwdML2DLRDlp0xzmsQXRk8oHuvwGvG1aMjj6cpUqO+0rz2Sg/wvHOgUpkRH8VJXvmlkhafMLCMtUtk5JIx7e+fkzCby+fnmD7kMkGLrT+OaExWwEDmNlCAt0TPKcHSdwsjso2isXjtAsGevyCMke8ufnFYpjs746JES1eNzVnHnn2Kp/lqcm60GM+J8dLgRZp7fX0anW098xhKym6+xXFzqeju0vYRIHBPerv+r7skWxwk+a7Sd8msqVeYEv6NTqnyWvyWb6Yh8cvj04N6qm/T6C5FUPLQhzSaQgMVMU6yLqjPuu9DwIDAQAB" } } } rows { name { value: "hasSignature" } } rows { quad { p_iri { } o_literal { lex: "sUNDqTjhQEjrU4UeGZ4QIBg1UiGp79PGmyE9Xnmr9JtU4unkeh2/i8a9QVMZR/888/6WH6DNt0PHUZFzTXXGM5MfAg45r2cbBhKQATj33HHnlKdZi13mGTvn1BMBYk25gjCi8+xXvaOdF6x07djK8PqYHLdU+8rfNtDeQF63vvEOX3bILLpVSnKxKiyw1V+kpuZdKfuz6nUZqHwKvxtu+N0J+IgOoVaK+fCmwl8iRId1l7Sf/Px+ljPEP0CyX5LBFrYS8q//MboNrRiXwp4BvuLOwREpM6tKSnMONaWnSPpUtC3ZlwHdMatIYXfZv3uLalJaDrk8+0fJ92u5why8pA==" } } } rows { name { value: "hasSignatureTarget" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 1 } } } rows { name { value: "signedBy" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 120 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 110 } } }