rows { options { physical_type: PHYSICAL_STREAM_TYPE_QUADS max_name_table_size: 128 max_prefix_table_size: 16 max_datatype_table_size: 16 logical_type: LOGICAL_STREAM_TYPE_DATASETS version: 2 } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "RALRRzcTp2-0bwxqsE6K3G_NZVZ_QO529mQ7O236SUWaU" } } rows { namespace { name: "this" value { prefix_id: 1 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/RALRRzcTp2-0bwxqsE6K3G_NZVZ_QO529mQ7O236SUWaU/" } } rows { name { } } rows { namespace { name: "sub" value { prefix_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://qudt.org/schema/qudt/" } } rows { namespace { name: "qudt" value { prefix_id: 3 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.nanopub.org/nschema#" } } rows { namespace { name: "np" value { prefix_id: 4 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/o/ntemplate/" } } rows { namespace { name: "nt" value { prefix_id: 5 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" } } rows { namespace { name: "xsd" value { prefix_id: 6 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/dcmitype/" } } rows { namespace { name: "dcmitype" value { prefix_id: 7 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" } } rows { namespace { name: "rdfs" value { prefix_id: 8 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://orcid.org/" } } rows { namespace { name: "orcid" value { prefix_id: 9 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://example.org/mvikg/" } } rows { namespace { name: "mvikg" value { prefix_id: 10 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/kpxl/gen/terms/" } } rows { namespace { name: "gen" value { prefix_id: 11 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://qudt.org/vocab/unit/" } } rows { namespace { name: "unit" value { prefix_id: 12 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/dc/terms/" } } rows { namespace { name: "dct" value { prefix_id: 13 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" } } rows { namespace { name: "rdf" value { prefix_id: 14 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { namespace { name: "npx" value { prefix_id: 15 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/biolink/vocab/" } } rows { namespace { name: "biolink" value { prefix_id: 16 name_id: 2 } } } rows { prefix { id: 1 value: "http://www.w3.org/ns/prov#" } } rows { namespace { name: "prov" value { prefix_id: 1 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/ns/sosa/" } } rows { namespace { name: "sosa" value { prefix_id: 2 name_id: 2 } } } rows { prefix { value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "hasAssertion" } } rows { prefix { id: 5 value: "https://w3id.org/np/RALRRzcTp2-0bwxqsE6K3G_NZVZ_QO529mQ7O236SUWaU/" } } rows { name { value: "assertion" } } rows { name { value: "Head" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 3 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 4 name_id: 3 } o_iri { prefix_id: 5 } g_iri { } } } rows { name { value: "hasProvenance" } } rows { name { value: "provenance" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 } o_iri { prefix_id: 5 } } } rows { name { value: "hasPublicationInfo" } } rows { name { value: "pubinfo" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 4 } o_iri { prefix_id: 5 } } } rows { name { value: "type" } } rows { name { value: "Nanopublication" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 } o_iri { prefix_id: 4 } } } rows { name { value: "alt" } } rows { name { value: "label" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 } p_iri { prefix_id: 8 } o_literal { lex: "alternate allele" } g_iri { prefix_id: 5 name_id: 4 } } } rows { name { value: "comparedTo" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 10 name_id: 14 } o_literal { lex: "compared to" } } } rows { name { value: "effect" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "variant effect" } } } rows { name { value: "frequency" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "frequency" } } } rows { name { value: "has_biome" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "has biome" } } } rows { name { value: "length" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "variant length" } } } rows { name { value: "ref" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "reference allele" } } } rows { prefix { value: "http://purl.obolibrary.org/obo/" } } rows { name { value: "ECO_0000305" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 6 } o_literal { lex: "evidence" } } } rows { name { value: "Dataset" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 7 } o_literal { lex: "dataset" } } } rows { name { value: "description" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 13 } o_literal { lex: "description" } } } rows { name { value: "isPartOf" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "is part of" } } } rows { prefix { id: 9 value: "http://qudt.org/schema/qudt/" } } rows { name { value: "QuantityValue" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 9 } o_literal { lex: "quantity value" } } } rows { name { value: "hasUnit" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "unit" } } } rows { name { value: "numericValue" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "numeric value" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_literal { lex: "is a" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "label" } } } rows { name { value: "isFeatureOfInterestOf" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 2 name_id: 27 } o_literal { lex: "is feature of interest of" } } } rows { name { value: "isSampleOf" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "is sample of" } } } rows { name { value: "Gene" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 16 } o_literal { lex: "gene" } } } rows { name { value: "PhenotypicFeature" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "phenotypic feature" } } } rows { name { value: "SequenceVariant" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "sequence variant" } } } rows { name { value: "end_coordinate" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "end coordinate" } } } rows { name { value: "has_evidence" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "has evidence" } } } rows { name { value: "has_phenotype" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "has phenotype" } } } rows { name { value: "has_sequence_variant" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "has sequence variant" } } } rows { name { value: "in_taxon" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "in taxon" } } } rows { name { value: "start_coordinate" } } rows { quad { s_iri { } o_literal { lex: "start coordinate" } } } rows { prefix { id: 11 value: "https://w3id.org/np/o/ntemplate/" } } rows { name { value: "LiteralPlaceholder" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 12 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "alternate allele" } } } rows { name { value: "biome" } } rows { name { value: "ExternalUriPlaceholder" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 39 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } } } rows { name { value: "GuidedChoicePlaceholder" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the biome the taxon was sampled from (GOLD biome recommended)" } } } rows { name { value: "possibleValuesFromApi" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 42 } o_literal { lex: "https://www.ebi.ac.uk/ols4/api/select?ontology=gold&fieldList=iri,label,description&q=" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 14 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "compared to (the baseline/control the phenotype outcome was compared against)" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 15 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "variant effect" } } } rows { name { value: "endCoordinate" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 43 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "end coordinate (variant position)" } } } rows { name { value: "hasDatatype" } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" } } rows { name { value: "integer" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 44 } o_iri { prefix_id: 12 } } } rows { name { value: "evidence" } } rows { name { value: "EmbeddedResource" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 47 } } } rows { name { value: "LocalResource" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "evidence for this variant" } } } rows { name { value: "evidenceText" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 49 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "evidence text (quote/description from the source)" } } } rows { name { value: "freq" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 50 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 47 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the variant\'s frequency" } } } rows { name { value: "freqUnit" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 51 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "frequency unit" } } } rows { name { value: "possibleValue" } } rows { prefix { id: 15 value: "http://qudt.org/vocab/unit/" } } rows { name { value: "PERCENT" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 52 } o_iri { prefix_id: 15 } } } rows { name { value: "UNITLESS" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "freqValue" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "frequency value" } } } rows { name { value: "decimal" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 44 } o_iri { prefix_id: 12 name_id: 56 } } } rows { name { value: "gene" } } rows { name { value: "AgentPlaceholder" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 58 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 40 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the gene this variant and (optionally) phenotype belong to" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 42 } o_literal { lex: "https://w3id.org/np/l/nanopub-query-1.1/api/RAom4OoQ8U2K6A629YRXKo9-XU-ZJM7-KZs1h11OD6c1w/find-things?type=https://w3id.org/biolink/vocab/Gene" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 18 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "variant length (free text \342\200\224 not all source rows give a clean integer)" } } } rows { name { value: "organism" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 59 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 47 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the strain/organism this sample was taken from" } } } rows { name { value: "phenotype" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 60 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 47 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the phenotype associated with this gene" } } } rows { name { value: "phenotypeDescription" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 61 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "phenotype description (prose, e.g. \"DeltarfaH mutant elicited ROS production...\")" } } } rows { name { value: "project" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 62 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the PMC article/dataset this record is derived from (PMC URI, e.g. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3079231/)" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 19 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "reference allele" } } } rows { name { value: "sample" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 63 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 47 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the sample this gene was observed in" } } } rows { name { value: "soType" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 64 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "sequence variant type (Sequence Ontology)" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 42 } o_literal { lex: "https://www.ebi.ac.uk/ols4/api/select?ontology=so&fieldList=iri,label,description&q=" } } } rows { name { value: "st01" } } rows { name { value: "object" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 65 } p_iri { prefix_id: 14 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 63 } } } rows { name { value: "predicate" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 2 name_id: 27 } } } rows { name { value: "subject" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 57 } } } rows { name { value: "st02" } } rows { name { value: "GroupedStatement" } } rows { quad { s_iri { name_id: 69 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 70 } } } rows { name { value: "OptionalStatement" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "hasStatement" } } rows { name { value: "st03" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 5 } } } rows { name { value: "st04" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { s_iri { name_id: 73 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 62 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 13 name_id: 23 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 63 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 74 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 21 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 62 } } } rows { name { value: "st05" } } rows { quad { s_iri { name_id: 75 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 59 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 2 name_id: 28 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 63 } } } rows { name { value: "st06" } } rows { name { value: "taxon" } } rows { quad { s_iri { name_id: 76 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 77 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 36 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 59 } } } rows { name { value: "st07" } } rows { quad { s_iri { name_id: 78 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 39 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 17 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 77 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st08" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 79 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 29 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 57 } } } rows { name { value: "st09" } } rows { name { value: "variant" } } rows { quad { s_iri { name_id: 80 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 35 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 57 } } } rows { name { value: "st10" } } rows { quad { s_iri { name_id: 82 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 31 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { name { value: "st11" } } rows { name { value: "variantName" } } rows { quad { s_iri { name_id: 83 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 84 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { name { value: "st12" } } rows { quad { s_iri { name_id: 85 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 64 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st13" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 86 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 15 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 15 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st14" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 87 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 18 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 18 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st15" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 88 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 12 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 12 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st16" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 89 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 19 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 19 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st17" } } rows { name { value: "startCoordinate" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 90 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 91 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 37 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st18" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 92 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 43 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 32 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 71 } } } rows { name { value: "st19" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 93 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 70 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st20" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 94 } } } rows { name { value: "st21" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st22" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { s_iri { name_id: 94 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 46 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 33 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 95 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 6 name_id: 20 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 46 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 96 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 49 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 13 name_id: 22 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 46 } } } rows { name { value: "st23" } } rows { quad { s_iri { name_id: 97 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 70 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st24" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 98 } } } rows { name { value: "st25" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st26" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st27" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { s_iri { name_id: 98 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 50 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 16 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 99 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 9 name_id: 24 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 50 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 100 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 55 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 9 name_id: 26 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 50 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 101 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 51 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 9 name_id: 25 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 50 } } } rows { name { value: "st28" } } rows { quad { s_iri { name_id: 102 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 70 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st29" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 103 } } } rows { name { value: "st30" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st31" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "st32" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { s_iri { name_id: 103 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 60 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 34 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 57 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 104 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 30 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { name_id: 10 } } } rows { quad { p_iri { name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 60 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 105 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 61 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 60 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 106 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 66 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 14 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 67 } o_iri { prefix_id: 10 name_id: 14 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 68 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 60 } } } rows { quad { s_iri { name_id: 91 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "start coordinate (variant position)" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 44 } o_iri { prefix_id: 12 } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 77 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 40 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "the organism taxon the strain belongs to (NCBITaxon)" } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 42 } o_literal { lex: "https://www.ebi.ac.uk/ols/api/select?ontology=ncbitaxon&fieldList=iri,label,description&q=" } } } rows { name { value: "templateVersion" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 107 } p_iri { prefix_id: 13 name_id: 22 } o_literal { lex: "Declaring an MVIKG observation" } } } rows { name { value: "isVersionOf" } } rows { name { value: "template" } } rows { quad { p_iri { name_id: 108 } o_iri { prefix_id: 5 } } } rows { name { value: "AssertionTemplate" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 110 } } } rows { name { value: "UnlistedTemplate" } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "Declaring an MVIKG observation" } } } rows { prefix { id: 1 value: "https://w3id.org/kpxl/gen/terms/" } } rows { name { value: "governedBy" } } rows { prefix { id: 3 value: "https://w3id.org/spaces/" } } rows { name { value: "mvikg" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 1 name_id: 112 } o_iri { prefix_id: 3 } } } rows { name { value: "hasNanopubLabelPattern" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 } o_literal { lex: "${variantName}" } } } rows { quad { p_iri { name_id: 72 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 65 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 69 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 73 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { name_id: 78 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { name_id: 82 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { name_id: 85 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { name_id: 92 } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { quad { o_iri { } } } rows { name { value: "hasTag" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 115 } o_literal { lex: "Biology" } } } rows { name { value: "hasTargetNanopubType" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 16 name_id: 31 } } } rows { name { value: "IntroducedResource" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 81 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 117 } } } rows { quad { o_iri { name_id: 48 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "this sequence variant" } } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 84 } p_iri { prefix_id: 14 name_id: 10 } o_iri { prefix_id: 11 name_id: 38 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "variant name/notation (e.g. T77I)" } } } rows { prefix { value: "http://www.w3.org/ns/prov#" } } rows { name { value: "wasAttributedTo" } } rows { prefix { id: 15 value: "https://orcid.org/" } } rows { name { value: "0009-0005-5515-1230" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 name_id: 4 } p_iri { prefix_id: 4 name_id: 118 } o_iri { prefix_id: 15 } g_iri { prefix_id: 5 name_id: 7 } } } rows { prefix { id: 7 value: "https://w3id.org/np/" } } rows { name { value: "created" } } rows { datatype { value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 7 name_id: 1 } p_iri { prefix_id: 13 name_id: 120 } o_literal { lex: "2026-11-04T12:15:21Z" datatype: 1 } g_iri { prefix_id: 5 name_id: 9 } } } rows { name { value: "creator" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 13 name_id: 121 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 119 } } } rows { name { value: "license" } } rows { prefix { id: 2 value: "https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 13 name_id: 122 } o_iri { prefix_id: 2 name_id: 2 } } } rows { prefix { id: 6 value: "http://purl.org/nanopub/x/" } } rows { name { value: "embeds" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 123 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 107 } } } rows { name { value: "introduces" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 124 } o_iri { prefix_id: 5 name_id: 109 } } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 8 name_id: 13 } o_literal { lex: "Declaring an MVIKG observation" } } } rows { name { value: "wasCreatedFromProvenanceTemplate" } } rows { name { value: "RA-yPZEYODCS39dWOWm7NA_ClOGFHzPi8iYhLzoZf19GI" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 125 } o_iri { prefix_id: 7 } } } rows { name { value: "wasCreatedFromPubinfoTemplate" } } rows { name { value: "RA4o9JqSxNO2Z47itbAcxvpVfdR97t_7usxmdR90URXQs" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 } o_iri { prefix_id: 7 } } } rows { name { id: 3 value: "wasCreatedFromTemplate" } } rows { name { id: 5 value: "RAgeON_vGgJCt5E4DPMi0eOPaGwNv9tbfFTRZtBwdQL0w" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 11 name_id: 3 } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 5 } } } rows { name { value: "sig" } } rows { name { id: 8 value: "hasAlgorithm" } } rows { quad { s_iri { prefix_id: 5 } p_iri { prefix_id: 6 name_id: 8 } o_literal { lex: "RSA" } } } rows { name { id: 11 value: "hasPublicKey" } } rows { quad { p_iri { name_id: 11 } o_literal { lex: "MIIBIjANBgkqhkiG9w0BAQEFAAOCAQ8AMIIBCgKCAQEAjO3oH8Lq/l1oZIUY3FlCz5DnndybGvAhBdmEJ/yq7Nv3GZEYPrEro23rCBCp0GiriOXlVbk61pA/7JFE6tqzTresINW6QQMxE9sIhCBlX4cG66JFD8ud6bMvUyzCR8LQA6zfrSbafGE06rvglJd4MDUcTwvUKqtL9UCnOaowVfnZ3sPOe9EqlmJuO3iHGxBSXMPOPEJZUzMXsFDWFuMZTnrR8gY3r5nVF5a8L/MD135ZH8qW5yGXOB28CmVYCAbw2o07QEKzyzFKN+W1gfnprYZvuKzwGexnzcdzc1S8N/M5bzhWQ40EKCEqgUE8c81OzEMm1HUlUKEJ/o5I/FKKAwIDAQAB" } } } rows { name { id: 52 value: "hasSignature" } } rows { quad { p_iri { name_id: 52 } o_literal { lex: "ChSF6c0V/t7cmQmsRqXEYzTq9LnmmdAeGtEIjTUQiaHZVxfGYAaRhZrm2pcTEQofgMppSO2KZHPYO9/LN8fg7vWQlcy1CELQaPzJpOX1rPvQcSVMsrjhTO+r2Xlkv1HoW2Gbe5JdYeVJAEFED5nvMzwdBp0pBjVLKEqZuUFKH0Nf9mdHIzOFk95nVGMxhZo67WArSjbrFaxGFH4AVfZ+hO2mUZnHvakVAvWd95WEJN4lYdRQDuv62ZooJhrqE+EJUmxlwK3BsnBLffXUghT1JOEV+4Z4iotVRxapj7FMSjxiFTMmhU/iF6Vq8qpidTRGp38uJgScM3XT7MjlCVOXWQ==" } } } rows { name { value: "hasSignatureTarget" } } rows { quad { p_iri { } o_iri { prefix_id: 7 name_id: 1 } } } rows { name { value: "signedBy" } } rows { quad { p_iri { prefix_id: 6 name_id: 54 } o_iri { prefix_id: 15 name_id: 119 } } }